《轩辕剑3云和山的彼端》是轩辕剑从DOS平台转向WINDOWS平台的第一作，也是音乐制作从传统的FM音源时代转向WAV音源时代的开始，也正是在这作开始延请“猫与狗管弦乐队”协助取音制作。轩三制作场面宏大，横跨欧亚大陆，其中欧洲、中东和中国三部分风格迥异，别有风味。也正是由于地域的独特性，地图场景完全不能共用，要如何将三种不同风格的曲风表现出来，正是对于新进DOMO的毛兽的最有挑战性之处。吴欣睿在欧洲部分大量使用管弦器乐，并尝试加入圣歌吟唱，尤其是“魔鬼的赞歌”首次将合唱和管弦乐结合起来，虽然只有一小段，然而这却是当时国内的首次尝试。中东部分原本准备采取中东特有乐器来实现，然而由于技术和时间的关系，故仍采取管弦制作，最终的效果却是出奇的好。中国部分沿用了轩辕剑黄金纪念版的音乐，给老玩家无比的亲切感。在单曲方面，主题曲“赛特”分别使用四种方式演绎，长笛版清新自然，管弦版辉煌大气，各有意境。“大唐帝国”一首中尝试首次使用琵琶和管弦合奏，展现出了大唐盛世时的那种恢弘、自信、明朗的气势。